Ambas estão correctas, mas diferem quanto à sua significação. A primeira é uma subordinada adjectiva relativa explicativa e quer dizer que os alunos moram em Lisboa. A segunda é uma subordinada adjectiva relativa restritiva e significa que, na turma, há alguns alunos que moram em Lisboa. Só as subordinadas adjectivas relativas explicativas é que podem ser separadas por vírgulas, pois o seu uso equivale ao de um aposto.